数控镗床，主要有数控卧式镗床，数控落地镗床，由于控制的轴数不同，以及工作台的结构不同，编程的方法不尽相同。

多数的数控镗床系列，具有CNC控制XYZW四轴，如果配置数控回转工作台，就具备B轴。例如数控落地镗铣床，卧式镗铣加工中心均具有XYZBW五轴四联动功能。

国内数控镗铣床，配置的数控系统有广州数控，北京凯恩帝，日本发那科等系统。数控落地镗铣床配置的数控系统多数为日本发那科，德国西门子，西班牙法格等。

编程的指令多数为国际通用代码，均采用绝对值编程更为合理准确。

编程主要根据先加工面，后加工孔的合理工艺，数控卧式镗床的主轴或数控落地镗铣床的主轴和方滑枕，在编制加工程序时伸出的距离尽量缩短。